规划提出，随着区域内综合运输体系的不断完善，宁波—舟山港服务范围应进一步延伸和拓展，成为以能源、原材料等大宗物资中转和外贸集装箱运输为主的现代化、多功能的综合性国际港口。宁波—舟山港应围绕镇海、算山、大榭、岙山、册子岛的大型石化泊位，形成石化工业、原油“海进江”转运体系和国家石油战略储备基地；加快北仑、马迹山、六横、衢山大型干散货中转运输基地建设，加强矿石、煤炭中转及后方工业配套服务体系建设，完善大宗散货运输系统；加强北仑、穿山、大榭、梅山、金塘和六横等集装箱专业化港区建设，进一步完善上海国际航运中心南翼集装箱干线运输的重要口岸，成为杭州湾北岸临海工业园区发展的重要依托。
规划对主要货类大型专业化码头作了布局：煤炭运输系统，为完善台州、温州等地电厂所需煤炭的中转服务功能，同时为满足全省能源物资储备的需要，规划在舟山六横岛结合电厂布局建设煤炭中转储备基地，以建设7万～15万吨级泊位为主，在接卸北方来煤的同时，接卸外贸进口煤炭并满足部分电厂配煤要求。石油运输系统，在算山、大榭、册子、岙山布局建设大型原油码头，主要为本省、上海及长江沿线石化企业服务；外贸进口原油在上述码头一程接卸后，由新建的甬沪宁管线向沿长江炼油厂输送。大型油气码头，北部以宁波—舟山港的镇海、北仑、大榭、岙山和洋山港区为主，远期视发展需求，规划在舟山、台州、温州等地的岛屿开辟新点。铁矿石运输系统，在北仑、马迹山、六横、衢山等地布局建设10万～30万吨级矿石专用码头，承担一程接卸任务，远期视沿海钢厂的布局，相应配套建设矿石接卸泊位。集装箱运输系统，以宁波—舟山港为干线港、温州港为支线港，嘉兴、台州港在发展喂给运输的同时，积极发展近洋支线运输。宁波—舟山港成为上海国际航运中心南翼集装箱干线港。
规划指出，推进宁波—舟山港域一体化，大力建设三大基地。坚持“统一规划、统一开发、统一品牌、统一管理”，推进宁波—舟山港域资源整合，尤其是整合北仑、金塘、穿山、大榭、梅山、六横、洋山等港区的深水资源，发挥省内陆上交通优势，强化集装箱干线港功能，以集装箱港区为依托，以能源、原材料、粮食等大宗物资为重点，整合港口和后方土地资源，建设北仑、金塘、穿山、洋山等物流园区，使宁波—舟山港成为集大型集装箱运输为主的物流基地、大宗物资储备中转基地和大型临港工业基地等多种功能于一体的现代化综合性港口。
