经过近4年的试运行，海口港二期深水码头4月1日通过验收，正式对外启用，既改变海口无专业国际邮轮泊位的历史，也将有力促进海口港向环北部湾集装箱枢纽港迈进。
为满足海南省港口腹地经济、集装箱和国际客运发展的需要，海口港从2003年开始进行二期深水泊位起步工程的前期工作，2006年12月19日开工建设，2009年6月18日投入试运行。
海口港二期深水泊位起步工程总用地面积84.91万平方米，泊位为2个3万吨级泊位，结构按5万吨级设计，其中西侧泊位兼停国际邮轮。该工程计划吞吐量为45万TEU/年，客运10万人次/年(单向)，进出港航道等级为3万吨级集装箱船型单向，目前已疏浚至5万吨级。该码头已配备5台岸桥、10台场地吊等机械设备，所有码头及配套设备均正常运行。
该工程投产试运行至今年1月，共完成出入境船舶2590艘次，外贸箱32万TEU。2012年海口港单港集装箱箱量突破100万箱，一跃跻身“单港百万标箱大港”行列，为将海口打造成为环北部湾集装箱中心枢纽奠定了坚实的基础。
另据中港网资料，今年海口马村港中心港区扩建将完成秀英港散件码头80%以上的搬迁，马村港二期今年底基本完工并投入使用。待今年建成的4个2万吨级通用散杂货泊位投用后，马村中心港区新建成码头年吞吐量将达2230万吨，其中集装箱吞吐量130万TEU。马村港区也将逐步发展成为海口港的核心港区。随着马村港区的建成，2015年，秀英港区原有的散杂货和集装箱业务将逐步转移到马村港区。届时，海口港集装箱业务将再得到快速发展。
海口港集装箱年吞吐量从1989年的3万标箱到2009年的50万标箱，用了20年时间，而从2009年的50万标箱到2012年的100万标箱，仅用了3年时间，无不得益于基础设施的改善。据中港网资料，目前很多船务公司以海口作为环北部湾一个中转港，开通南北干线，与环北部湾的各条支线对接起来，大大增加了运力。同时，近年来，海南大项目加速建设，进岛的钢材、水泥等建材数量激增，也拉动了港口货物吞吐量和集装箱箱量的快速增长。
截止到去年底，海口港集装箱已开通28条内贸航线，覆盖华南、华东、华北、东北沿海主要港口及长江水系主要港口。另外，两条外贸航线通过香港和越南胡志明市辐射到东亚、东南亚、西亚乃至欧美地区，使集装箱业务得到空前发展。
