2003年对于中国的煤炭行业来说，可谓是心情最为舒畅的一年。这一年规模以上煤炭企业盈利140亿元。但濮洪九说，这种盈利是在职工人均工资收入比全国平均水平低1050元、比中央电力企业职工平均工资低16217元，安全生产欠账500多亿元没有补还和大量资产损失没有得到及时处理的基础上实现的。如果考虑其中某一项因素，全行业就会由盈变亏。
长期以来不完善的价格形成机制，造成煤炭价格扭曲，市场价格信号失真，不仅造成煤炭行业自身的效率损失、政府财政负担的增加，而且导致其他行业能源使用的浪费和增加国民经济结构调整的难度。
较低的煤炭价格，导致煤炭工业与其他工业部门的利润水平相差悬殊。就是煤炭经济形势最好的2003年，行业净资产利润率只有6.04％，仅是当年全国规模以上工业企业平均净资产利润率12.06％的一半。煤炭行业自第一个五年计划以来的50年中，一直处于微利和亏损边缘。在财政补贴不足的年份，煤炭企业不得不减少生产、安全投入，降低职工收入和动用维简费和职工工资基金来弥补亏损。大量的补亏，使企业不仅失去了自我完善、自我发展的能力，就连简单再生产也维持不了，导致职工收入大幅度下降，矿井采掘失调，设备老化失修，安全设施和职工生活福利欠账多，严重影响了生产后劲和职工队伍的稳定。多年的经济困难，使煤矿积累的矛盾越来越大，潜在社会问题越来越突出。行业竞争能力下降，企业普遍缺少积累，建设新的矿井没有资金，甚至有相当数量的大型煤炭企业无力支付矿权评估费和转让金，发展更是无从谈起。
煤炭价格扭曲影响了供应效率。尽管煤炭价格已经放开，但部分电煤价格还是在政府协调下形成的。受市场供求关系的影响，近几年煤炭价格处于上涨态势，政府协调下形成的价格大大低于市场煤价格，而且还有逐步拉大的趋势。目前电煤价格矛盾格外突出，并在一定程度上降低了煤炭供应效率。
煤炭价格扭曲增加了国家财政负担。较低的煤炭价格使煤矿收益率低下，国家不得不投入巨资支持煤炭工业。据统计，1985-2003年中央财政动用512多亿元资金补贴煤矿亏损。1998年以来，中央和地方财政出资400多亿元用于国有煤矿关闭破产，预计将突破600亿元；每年出资46亿元，通过转移支付弥补国有煤矿养老金缺口，累计已经达到588亿元；出资59亿多元用于煤矿安全技术改造；2003-2004年中央财政出资近70亿元用于煤矿采煤沉陷区治理，预计今后国家还要拿出更多的资金支持煤矿采煤沉陷区治理，给国家财政造成了沉重负担。
煤炭价格扭曲降低了煤炭资源利用效率。虽然我国煤炭资源比较丰富，但人均占有可采储量仅为世界平均水平53.9％。在我国现有生产力水平条件下，按照1990年不变价格计算，1吨煤大约可创造2000-3000元的产值，经济发达地区还要高一些。但由于煤炭价格偏低，对大多数用煤企业来说，煤炭或作为燃料，或作为原料，均在产品成本中所占的比重变小。实行煤炭低价政策，等于国家用巨额补贴补了用煤企业，用煤多少对其经济效益影响不大，因而普遍缺乏节约煤炭资源的压力和动力，更不愿投资于节能措施，造成煤炭利用率低，浪费惊人。2003年，我国GDP仅占世界总数的5％左右，但煤炭消费确达到了30％以上。
煤炭价格扭曲增加了国民经济结构调整的难度。我国煤炭价格长期偏低，实际上已成为对使用能源企业的一种优惠。能耗高、生产落后的企业不能淘汰。煤价低，收益差，谁也不愿投资办煤矿，而把大量资金投到价高利大的加工工业上去，造成短线更短，长线更长，使我国经济结构性失衡进一步加剧。只有建立完善的煤炭价格形成机制，才能促进煤炭合理价格的形成，提高行业收益率，吸引更多的资金，促进煤炭产业结构调整和优化。
